Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB4AP20338 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms