Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPA1P20036 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPA1P20036 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPA1P20036 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms