Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TNNI3P19429 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNNI3P19429 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms