Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCAM1P19320 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms