Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FLT1P17948 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FLT1P17948 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FLT1P17948 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FLT1P17948 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FLT1P17948 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FLT1P17948 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FLT1P17948 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FLT1P17948 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FLT1P17948 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FLT1P17948 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FLT1P17948 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FLT1P17948 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FLT1P17948 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FLT1P17948 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FLT1P17948 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FLT1P17948 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FLT1P17948 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FLT1P17948 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FLT1P17948 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FLT1P17948 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FLT1P17948 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FLT1P17948 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FLT1P17948 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FLT1P17948 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.2 ms