Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSCAN20P17040 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSCAN20P17040 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZSCAN20P17040 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms