Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GNB3P16520 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GNB3P16520 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GNB3P16520 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GNB3P16520 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GNB3P16520 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GNB3P16520 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GNB3P16520 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GNB3P16520 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GNB3P16520 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GNB3P16520 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms