Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRAFP15056 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRAFP15056 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRAFP15056 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRAFP15056 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAFP15056 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAFP15056 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRAFP15056 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRAFP15056 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRAFP15056 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAFP15056 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAFP15056 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAFP15056 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAFP15056 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRAFP15056 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms