Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC5A1P13866 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms