Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A3P13637 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A3P13637 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP1A3P13637 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP1A3P13637 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP1A3P13637 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms