Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH1P12830 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH1P12830 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH1P12830 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH1P12830 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH1P12830 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH1P12830 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH1P12830 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH1P12830 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH1P12830 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH1P12830 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms