Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNB1P11230 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms