Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSPD1P10809 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSPD1P10809 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSPD1P10809 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms