Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRFP10586 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRFP10586 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms