Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPP1P10451 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPP1P10451 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPP1P10451 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPP1P10451 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms