Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2CP0DJJ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2CP0DJJ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms