Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRSS56P0CW18 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRSS56P0CW18 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRSS56P0CW18 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms