Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00032P0C843 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LINC00032P0C843 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms