Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
HOXB7P09629 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB7P09629 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB7P09629 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms