Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXC4P09017 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXC4P09017 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms