Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPAP09012 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms