Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT7P08729 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT7P08729 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT7P08729 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT7P08729 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT7P08729 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT7P08729 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT7P08729 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT7P08729 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT7P08729 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT7P08729 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT7P08729 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT7P08729 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT7P08729 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT7P08729 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT7P08729 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT7P08729 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms