Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HSP90AB1P08238 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HSP90AB1P08238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms