Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NGFRP08138 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NGFRP08138 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NGFRP08138 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NGFRP08138 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NGFRP08138 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NGFRP08138 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NGFRP08138 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NGFRP08138 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NGFRP08138 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NGFRP08138 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NGFRP08138 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NGFRP08138 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NGFRP08138 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NGFRP08138 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NGFRP08138 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NGFRP08138 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NGFRP08138 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NGFRP08138 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NGFRP08138 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms