Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGBP05060 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGBP05060 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGBP05060 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGBP05060 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGBP05060 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGBP05060 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGBP05060 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGBP05060 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGBP05060 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHGBP05060 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHGBP05060 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHGBP05060 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHGBP05060 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHGBP05060 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHGBP05060 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHGBP05060 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHGBP05060 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHGBP05060 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGBP05060 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGBP05060 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGBP05060 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHGBP05060 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms