Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTNP04004 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTNP04004 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTNP04004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VTNP04004 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTNP04004 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VTNP04004 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTNP04004 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTNP04004 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTNP04004 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTNP04004 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTNP04004 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTNP04004 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTNP04004 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms