Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMNAP02545 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMNAP02545 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMNAP02545 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNAP02545 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMNAP02545 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMNAP02545 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMNAP02545 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMNAP02545 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms