Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCAP01258 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCAP01258 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALCAP01258 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALCAP01258 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCAP01258 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCAP01258 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCAP01258 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCAP01258 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALCAP01258 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALCAP01258 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALCAP01258 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALCAP01258 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCAP01258 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCAP01258 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALCAP01258 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCAP01258 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCAP01258 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCAP01258 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALCAP01258 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALCAP01258 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALCAP01258 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCAP01258 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCAP01258 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALCAP01258 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms