Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P00734 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P00734 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
F2P00734 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F2P00734 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
F2P00734 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
F2P00734 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F2P00734 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F2P00734 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
F2P00734 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P00734 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
F2P00734 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
F2P00734 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
F2P00734 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
F2P00734 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
F2P00734 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
F2P00734 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P00734 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P00734 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F2P00734 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F2P00734 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
F2P00734 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms