Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX11BO96011 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms