Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZBED1O96006 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZBED1O96006 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms