Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACSL3O95573 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL3O95573 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms