Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LETM1O95202 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LETM1O95202 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LETM1O95202 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LETM1O95202 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LETM1O95202 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LETM1O95202 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LETM1O95202 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LETM1O95202 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LETM1O95202 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LETM1O95202 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms