Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNUPNO95149 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNUPNO95149 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms