Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM13AO94988 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM13AO94988 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM13AO94988 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms