Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOBTB3O94955 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOBTB3O94955 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOBTB3O94955 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms