Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ECM2O94769 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM2O94769 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ECM2O94769 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM2O94769 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ECM2O94769 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ECM2O94769 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ECM2O94769 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ECM2O94769 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms