Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP72O76094 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP72O76094 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP72O76094 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRP72O76094 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP72O76094 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP72O76094 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP72O76094 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP72O76094 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP72O76094 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRP72O76094 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRP72O76094 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRP72O76094 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRP72O76094 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRP72O76094 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRP72O76094 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRP72O76094 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP72O76094 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP72O76094 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP72O76094 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP72O76094 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRP72O76094 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP72O76094 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP72O76094 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP72O76094 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRP72O76094 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRP72O76094 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP72O76094 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP72O76094 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP72O76094 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP72O76094 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP72O76094 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms