Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SURF6O75683 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SURF6O75683 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SURF6O75683 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SURF6O75683 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SURF6O75683 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SURF6O75683 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SURF6O75683 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SURF6O75683 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SURF6O75683 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SURF6O75683 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SURF6O75683 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SURF6O75683 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SURF6O75683 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SURF6O75683 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SURF6O75683 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SURF6O75683 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SURF6O75683 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SURF6O75683 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SURF6O75683 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SURF6O75683 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SURF6O75683 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SURF6O75683 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SURF6O75683 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms