Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKAP2O75563 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKAP2O75563 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms