Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 CREB1-211ENST00000452474 518 ntTSL 47.03□□□□□ -1.283e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 27.03□□□□□ -1.283e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 KDM3B-204ENST00000507996 3034 ntTSL 26.36□□□□□ -1.391e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 BCAS3-206ENST00000585979 919 ntTSL 56.19□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 ZNF577-217ENST00000640678 1800 ntTSL 24.98□□□□□ -1.613e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 42.61□□□□□ -1.993e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 BRCA2-207ENST00000614259 7950 ntTSL 21.48□□□□□ -2.172e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.239e-9■■■■■ 183.6
SF3B1O75533 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.179e-9■■■■■ 183.6
SF3B1O75533 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 183.6
SF3B1O75533 DOCK8-208ENST00000469197 741 ntTSL 58.05□□□□□ -1.129e-9■■■■■ 183.6
SF3B1O75533 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.914e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.164e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 LTK-205ENST00000563518 3444 ntTSL 218.39■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 SLC26A6-219ENST00000485361 575 ntTSL 415.72■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 317.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 24.75□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 183.1
SF3B1O75533 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 519.75■□□□□ 0.756e-9■■■■■ 182.7
SF3B1O75533 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 518.61■□□□□ 0.576e-9■■■■■ 182.7
SF3B1O75533 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 182.6
SF3B1O75533 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 182.6
SF3B1O75533 CCDC57-201ENST00000327026 5379 ntTSL 215.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 182.4
SF3B1O75533 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 182.4
SF3B1O75533 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 182.4
SF3B1O75533 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 59.65□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 182.4
SF3B1O75533 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 210.9□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 182.2
SF3B1O75533 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.344e-8■■■■■ 182.2
SF3B1O75533 TESC-202ENST00000462502 854 ntTSL 523.21■■□□□ 1.314e-8■■■■■ 182.2
SF3B1O75533 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 182.2
SF3B1O75533 TESC-203ENST00000470612 1057 ntTSL 221.89■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 182.2
SF3B1O75533 TESC-204ENST00000482176 841 ntTSL 321.77■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 182.2
SF3B1O75533 INTS1-206ENST00000493446 675 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 182.1
SF3B1O75533 INTS1-205ENST00000483196 386 ntTSL 511.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 182.1
SF3B1O75533 MAP4-216ENST00000633710 570 ntTSL 56□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 181.8
SF3B1O75533 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 181.8
SF3B1O75533 MAP2K2-203ENST00000593364 872 ntTSL 521.47■■□□□ 1.033e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.931e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.911e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.871e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-212ENST00000497830 2227 ntTSL 1 (best)20.28■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-211ENST00000495767 1860 ntTSL 220■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 ADAM8-211ENST00000561175 481 ntTSL 519.77■□□□□ 0.761e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-205ENST00000476176 1906 ntTSL 218.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 PKP3-207ENST00000530695 441 ntTSL 518.74■□□□□ 0.593e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.521e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-205ENST00000520623 1923 ntTSL 1 (best)17.78■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.413e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 217.38■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-208ENST00000521684 935 ntTSL 316.92■□□□□ 0.33e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MAP2K2-211ENST00000602167 431 ntTSL 516.87■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-211ENST00000551534 571 ntTSL 416.85■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-207ENST00000549497 567 ntTSL 415.35■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.023e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-211ENST00000432151 1000 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 HCN3-202ENST00000467204 957 ntTSL 512.65□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 HCN3-204ENST00000496230 3245 ntTSL 212.11□□□□□ -0.473e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 IMPDH1-206ENST00000468842 587 ntTSL 311.86□□□□□ -0.513e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 NF2-206ENST00000361676 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MAP2K2-205ENST00000597008 866 ntTSL 211.23□□□□□ -0.613e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MRE11-210ENST00000541157 594 ntTSL 410.55□□□□□ -0.723e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 SELENOF-205ENST00000469566 831 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-14■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 MRE11-208ENST00000538923 558 ntTSL 59.85□□□□□ -0.833e-10■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 ARNT-206ENST00000497108 546 ntTSL 49.64□□□□□ -0.876e-9■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 ARNT-207ENST00000504358 571 ntTSL 49.26□□□□□ -0.936e-9■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 DAZAP2-212ENST00000551919 485 ntTSL 48.82□□□□□ -12e-7■■■■■ 180.9
SF3B1O75533 ACAP2-216ENST00000635383 1647 ntTSL 58.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 180.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 289 ms