Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIA4O75335 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPFIA4O75335 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIA4O75335 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms