Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH16O75309 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH16O75309 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH16O75309 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH16O75309 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH16O75309 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH16O75309 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH16O75309 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH16O75309 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH16O75309 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH16O75309 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH16O75309 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms