Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPFIA3O75145 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms