Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC22O60826 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC22O60826 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms