Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF10O60809 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PRAMEF10O60809 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF10O60809 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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