Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMFO60524 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEMFO60524 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEMFO60524 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEMFO60524 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMFO60524 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMFO60524 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMFO60524 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEMFO60524 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEMFO60524 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEMFO60524 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEMFO60524 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEMFO60524 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEMFO60524 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEMFO60524 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEMFO60524 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEMFO60524 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEMFO60524 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms