Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPOPO43791 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPOPO43791 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPOPO43791 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPOPO43791 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOPO43791 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOPO43791 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOPO43791 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOPO43791 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPOPO43791 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPOPO43791 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPOPO43791 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPOPO43791 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPOPO43791 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPOPO43791 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPOPO43791 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms