Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT86O43790 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT86O43790 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT86O43790 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT86O43790 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT86O43790 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT86O43790 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT86O43790 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT86O43790 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT86O43790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT86O43790 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT86O43790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT86O43790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT86O43790 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT86O43790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT86O43790 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms