Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLF4O43474 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLF4O43474 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLF4O43474 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLF4O43474 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLF4O43474 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLF4O43474 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLF4O43474 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLF4O43474 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLF4O43474 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLF4O43474 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms